Matkustajan on ilmoitettava jo lentovarauksen yhteydessä täydellinen nimensä sellaisena kuin se on passissa esitetty sekä sukupuolensa ja syntymäaikansa.
Lentoyhtiö lähettää tiedot TSA:lle 72 tuntia ennen lennon lähtöaikaa. TSA vertaa tietoja valvontalistoihin tarkoituksenaan tunnistaa epäiltyjä terroristeja, estää lentokiellossa olevia henkilöitä pääsemästä lennoille sekä tunnistaa henkilöitä, joiden kohdalla tehostettu turvatarkastus pitää toteuttaa.
Kun matkustajan tiedot on verrattu valvontalistoihin, Secure Flight -järjestelmä lähettää tuloksen lentoyhtiölle. Seulontatuloksen ollessa Negatiivinen, matkustajaa ei voida hyväksyä lennolle ilman lisäselvityksiä. Lisäselvitykset saattavat kuitenkin muuttaa tuloksen positiiviseksi, jolloin matkustaja voidaan hyväksyä lennolle.
Lentoyhtiö ei voi hyväksyä lennolleen henkilöä, jolta puuttuu Secure Flight -seulontatulos. Tästä syystä on tärkeää, että vaaditut tiedot löytyvät varauksesta viimeistään 72 tuntia ennen lähtöaikaa. Jos varaus tehdään lähempänä matkustusajankohtaa, lentoyhtiö toimittaa tiedot TSA:lle varausvahvistuksen yhteydessä.
Lisätietoa Secure Flight -vaatimuksesta löytyy TSA:n internetsivuilta osoitteessa http://www.tsa.gov/what_we_do/layers/secureflight/.